Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scaf8Q6DID3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms