Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Smarca2Q6DIC0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Smarca2Q6DIC0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms