Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11bQ6DFW5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms