Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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