Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms