Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms