Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms