Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9aQ68FE2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg9aQ68FE2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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