Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms