Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CltcQ68FD5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CltcQ68FD5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms