Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4eQ66X19 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms