Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp9Q64HY3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp9Q64HY3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms