Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc18Q640L5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
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