Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms