Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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