Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms