Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms