Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrhQ62361 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrhQ62361 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrhQ62361 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms