Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim28Q62318 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms