Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SypQ62277 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SypQ62277 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms