Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms