Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall3Q62255 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms