Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sycp1Q62209 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms