Protein–RNA interactions for Protein: Q62193

Rpa2, Replication protein A 32 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa2Q62193 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa2Q62193 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms