Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim27Q62158 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Trim27Q62158 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Trim27Q62158 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Trim27Q62158 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Trim27Q62158 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Trim27Q62158 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Trim27Q62158 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim27Q62158 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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