Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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PtprrQ62132 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PtprrQ62132 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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PtprrQ62132 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PtprrQ62132 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PtprrQ62132 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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