Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm1Q61937 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm1Q61937 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm1Q61937 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm1Q61937 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm1Q61937 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm1Q61937 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Npm1Q61937 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms