Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itga7Q61738 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga7Q61738 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms