Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd47Q61735 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms