Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrxQ61687 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms