Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsx2Q61412 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms