Protein–RNA interactions for Protein: Q61205

Pafah1b3, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b3Q61205 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pafah1b3Q61205 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pafah1b3Q61205 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms