Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hcfc1Q61191 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hcfc1Q61191 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hcfc1Q61191 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hcfc1Q61191 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hcfc1Q61191 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hcfc1Q61191 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms