Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Foxf1Q61080 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Foxf1Q61080 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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