Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms