Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift20Q61025 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms