Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms