Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Neurod1Q60867 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms