Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms