Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms