Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms