Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms