Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms