Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cpa6Q5U901 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpa6Q5U901 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpa6Q5U901 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpa6Q5U901 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpa6Q5U901 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpa6Q5U901 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpa6Q5U901 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpa6Q5U901 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpa6Q5U901 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpa6Q5U901 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms