Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc11Q5U458 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnajc11Q5U458 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms