Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabl6Q5U3K5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabl6Q5U3K5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabl6Q5U3K5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabl6Q5U3K5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabl6Q5U3K5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabl6Q5U3K5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabl6Q5U3K5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabl6Q5U3K5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabl6Q5U3K5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabl6Q5U3K5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabl6Q5U3K5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms