Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms