Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TefmQ5SSK3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms