Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms