Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH8

Cyb5d2, Neuferricin, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5d2Q5SSH8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms